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上海交大生命科学技术学院研究生导师简介:白林泉(生物工程系)

来源:www.sjtuky.com 作者:鸿知上交大考研网 浏览:45 次 发布时间:2018/12/3

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上海交大生命科学技术学院研究生导师简介:白林泉(生物工程系)


基本信息

姓名:白林泉

职称:教授

E-Mail:bailq@sjtu.edu.cn

个人主页:mml.sjtu.edu.cn

联系电话:62932418


个人简介

男,19718月出生,博士,上海交通大学微生物学教授,博士导师,基金委“重要微生物合成与分解代谢的分子机理”创新研究群体和微生物代谢国家重点实验室研究骨干。1992年获得山东大学微生物系学士学位。1995年获得华中农业大学微生物专业硕士学位。1998年获得华中农业大学分子生物学专业理学博士学位。1999年至20024月在美国华盛顿大学化学系从事博士后研究。之后回国到上海交通大学生命科学技术学院工作。2006年至2007年初在德国Tuebingen大学微生物研究所从事生物合成调节方面的合作研究。主要从事抗肿瘤安丝霉素、抗水稻纹枯病井冈霉素等微生物药物的生物合成机理研究、合成生物学结构改造和功能基因组学研究,在PNASJACSNPRChemistry&BiologyAEMChembiochem等杂志发表50篇研究论文,其中第一作者及通讯作者20篇。研究成果被NatureBiotechnologyNatureChinaFacultyof1000Biology等专文评价,被评为06年“中国高等学校十大科技进展”、07年“教育部自然科学二等奖”和08年“国家自然科学二等奖”。07年应邀在第14届国际放线菌大会、08年在第13届国际生物技术大会做分组报告。承担和参加了国家自然科学基金4项及国家863计划项目2项。07年入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”,08年入选上海市教委“曙光人才计划”,09年获得“明治乳业生命科学奖”和“第十一届中国青年科技奖”。


研究方向

1、井冈霉素/有效霉素的生物合成

抗水稻纹枯病氨基环醇井冈霉素是重要的农用抗生素,也是我国开发最为成功的抗生素之一。在前期研究中,我们克隆了井冈霉素的生物合成基因簇并建立了产生菌的遗传操作系统。在此基础上,我们正在开展结构基因的功能、井冈霉素产生的温度调节和代谢工程产量提高方面的研究。井冈霉素产生菌的基因组学研究也在进行之中。


2、安莎类抗生素的生物合成机理与组合生物合成改造

安莎类抗生素是一类大环内酰胺类聚酮化合物,包含利福霉素、格尔登素、安丝菌素、萘霉素等,具有抗肿瘤、抗结核杆菌、抗细菌等多种生理活性。安莎类抗生素在基本骨架的合成方面具有一定相似性,产生了部分结构相似区域,但相互之间也存在较大差异,如不同的后修饰反应等。我们以安丝菌素和萘霉素为研究材料,正在开展安莎类抗生素的合成后修饰机理及其在组合生物合成中的应用、安莎环的环化与释放、复杂的生物合成调控机制等研究。


3、次生代谢产物生物合成基因资源挖掘

充分利用我国丰富的微生物资源和基因簇克隆的大量成果,通过关键结构基团合成基因保守区设计兼并性引物,通量筛选可能的次生代谢生物合成基因簇,然后以此为指导寻找目标化合物,建立化合物和合成基因资源库。

 

代表性论文(*通讯作者)

ZhengL,ZhouX,ZhangH,JiX,LiL,HuangL,BaiL*,ZhangH*.StructuralandfunctionalanalysisofvalidoxylamineA7'-phosphatesynthaseValLinvolvedinvalidamycinAbiosynthesis.PLoSOne.2012,7(2):e32033.

WangB,KangQ,LuY,BaiL,WangC.UnveilingthebiosyntheticpuzzleofdestruxinsinMetarhiziumspecies.ProcNatlAcadSciUSA.2012,109(4):1287-92.

LiY,ZhaoP,KangQ,MaJ,BaiL*,DengZ.Dualcarbamoylationsonthepolyketideandglycosylmoietybyasm21resultinextendedansamitocinbiosynthesis.ChemBiol.2011,18(12):1571-80.

KangQ,ShenY,BaiL*.Biosynthesisof3,5-AHBA-derivednaturalproducts.NatProdRep.2012,29(2):243-63.

JiangC,WangH,KangQ,LiuJ,BaiL*.CloningandcharacterizationofthepolyethersalinomycinbiosynthesisgeneclusterofStreptomycesalbusXM211.ApplEnvironMicrobiol.2012,78(4):994-1003.

ZhouX,WuH,LiZ,ZhouX,BaiL*,DengZ.Over-expressionofUDP-glucosepyrophosphorylaseincreasesvalidamycinAbutdecreasesvalidoxylamineAproductioninStreptomyceshygroscopicusvar.jinggangensis5008.MetabEng.2011,13(6):768-76.

KangQ,BaiL*,DengZ.TowardsteadfastgrowthofantibioticresearchinChina:Fromnaturalproductstoengineeredbiosynthesis.BiotechnolAdv.2011.

QiuJ,ZhuoY,ZhuD,ZhouX,ZhangL,BaiL*,DengZ.OverexpressionoftheABCtransporterAvtABincreasesavermectinproductioninStreptomycesavermitilis.ApplMicrobiolBiotechnol.2011,92(2):337-45.

WuY,KangQ,ShangG,SpitellerP,CarrollB,YuTW,SuW,BaiL*,FlossHG.N-methylationoftheamidebondbymethyltransferaseasm10inansamitocinbiosynthesis.Chembiochem.2011,12(11):1759-66.

WuY,KangQ,ShenY,SuW,BaiL*.CloningandfunctionalanalysisofthenaphthomycinbiosyntheticgeneclusterinStreptomycessp.CS.MolBiosyst.2011,7(8):2459-69.

WuQ,LiangJ,LinS,ZhouX,BaiL*,DengZ,WangZ*.Characterizationofthebiosynthesisgeneclusterforthepyrrolepolyetherantibioticcalcimycin(A23187)inStreptomyceschartreusisNRRL3882.AntimicrobAgentsChemother.2011,55(3):974-82.

HeY,SunY,LiuT,ZhouX,BaiL*,DengZ.Cloningofseparatemeilingmycinbiosynthesisgeneclustersbyuseofacyltransferase-ketoreductasedidomainPCRamplification.ApplEnvironMicrobiol.2010,76(10):3283-92.

XuH,ZhangY,YangJ,MahmudT*,BaiL*,DengZ.AlternativeepimerizationinC(7)N-aminocyclitolbiosynthesisiscatalyzedbyValD,alargeproteinofthevicinaloxygenchelatesuperfamily.ChemBiol.2009,16(5):567-76.

ZhangY,BaiL*,DengZ.Functionalcharacterizationofthefirsttwoactinomycete4-amino-4-deoxychorismatelyasegenes.Microbiology.2009,155(Pt7):2450-9.

ZhouY,MengQ,YouD,LiJ,ChenS,DingD,ZhouX,ZhouH*,BaiL*,DengZ.SelectiveremovalofaberrantextenderunitsbyatypeIIthioesteraseforefficientFR-008/candicidinbiosynthesisinStreptomycessp.strainFR-008.ApplEnvironMicrobiol.2008,74(23):7235-42.

XuH,YangJ,BaiL*,DengZ,MahmudT*.Geneticallyengineeredproductionof1,1'-bis-valienamineandvalidienamycininStreptomyceshygroscopicusandtheirconversiontovalienamine.ApplMicrobiolBiotechnol.2009,81(5):895-902.

ZhaoP,BaiL*,MaJ,ZengY,LiL,ZhangY,LuC,DaiH,WuZ,LiY,WuX,ChenG,HaoX,ShenY*,DengZ,FlossHG.AmideN-glycosylationbyAsm25,anN-glycosyltransferaseofansamitocins.ChemBiol.2008,15(8):863-74.

ZhangX,FenM,ShiX,BaiL*,ZhouP*.OverexpressionofyeastS-adenosylmethioninesynthetasemetKinStreptomycesactuosusleadstoincreasedproductionofnosiheptide.ApplMicrobiolBiotechnol.2008,78(6):991-5.

MinagawaK,ZhangY,ItoT,BaiL*,DengZ,MahmudT.ValC,anewtypeofC7-CyclitolkinaseinvolvedinthebiosynthesisoftheantifungalagentvalidamycinA.Chembiochem.2007,8(6):632-41.

DengZ,BaiL*.Antibioticbiosyntheticpathwaysandpathwayengineering--agrowingresearchfieldinChina.NatProdRep.2006,23(5):811-27.

BaiL,LiL,XuH,MinagawaK,YuY,ZhangY,ZhouX,FlossHG,MahmudT,DengZ*.FunctionalanalysisofthevalidamycinbiosyntheticgeneclusterandengineeredproductionofvalidoxylamineA.ChemBiol.2006,13(4):387-97.

YuTW,BaiL,CladeD,HoffmannD,ToelzerS,TrinhKQ,XuJ,MossSJ,LeistnerE,FlossHG*.ThebiosyntheticgeneclusterofthemaytansinoidantitumoragentansamitocinfromActinosynnemapretiosum.ProcNatlAcadSciUSA.2002,99(12):7968-73.

 

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